本发明属于天然高分子材料制备及应用领域，公开了一种纤维素／壳聚糖复合小球及其制备方法及其在中药液脱色中的应用。所述纤维素／壳聚糖复合小球的制备方法为：以离子液为溶剂，将纤维素和壳聚糖分别溶于其中，加热搅拌至完全溶解，再将纤维素溶解液和壳聚糖溶解液混合，加热交联直至混合液变成淡黄色均一的液体；将混合溶液逐滴滴入凝固浴中，得到凝胶态复合小球，将凝胶态复合小球浸泡后取出洗涤即得到产物纤维素／壳聚糖复合小球。本发明所述制备方法整个反应过程廉价、易行且环保；所得纤维素／壳聚糖复合小球对紫叶、罗汉果、乌梅、金银花等中草药水提液中的色素有良好的吸附效果，在中草药液纯化领域有着广阔的应用前景。