本发明公开了一种净化甲醛醇酸树脂及其制备方法。该净化甲醛醇酸树脂由多元醇、多元酸、有机溶剂、除醛剂和负离子发生剂反应制备而成；制备时，在氮气保护下，先加入多元醇和多元酸，升温至１００～１６０℃；再加入催化剂，升温至２２０～２６０℃，保温１～３．５小时；控制温度为２００～２２０℃，加入带水剂，升温至２５０～２８０℃回流至酸值小于７；加入有机溶剂，混合均匀，得到醇酸树脂；加入除醛剂，在２５～８０℃反应３～３０分钟，得到改性醇酸树脂，即为净化甲醛醇酸树脂。本发明净化甲醛醇酸树脂与甲醛反应后，生成的产物不具挥发性、无毒，不产生二次污染；制备工艺流程简单、对仪器设备要求低，适于大规模生产。